.... (начало последует)
Как добиться чтобы приложение увстанавливалось с правами администратора?
...
Существует Microsoft Client Profile Configuration Designer, который позволяет создавать свои по дизайну и тонко настраиваемые инсталляторы. Вот некоторые ссылки по теме: обзор из четырех частей, скачивать тут.